Utilizzo della reazione a catena della DNA polimerasi per il monitoraggio ambientale: Determinazione di Giardia lamblia come indicatore di inquinamento microbiologico

In questo lavoro è stato messo a punto un metodo per la determinazione di Giardia lamblia utilizzando la reazione a catena della DNA polimerasi (PCR) al fine di rendere più rapida, sensibile ed economica la diagnosi ambientale di tale microrganismo. Nell’ambiente la Giardia è presente sotto forma di cisti che possono essere ritrovate in corpi idrici nonché in sedimenti e fanghi. In tali ambienti le cisti sono in grado di rimanere vitali per diversi mesi. La trasmissione di tale parassita attraverso l’acqua è ampiamente confermata. Molti animali selvatici e domestici giocano un ruolo importante nella diffusione dei parassiti, che possono ritrovarsi nelle acque in seguito all’apporto diretto di feci o tramite acque di scarico, percolati, acque di dilavamento dei suoli agricoli, adibiti a pascolo o trattati con fanghi di depurazione contaminati. Scopo del lavoro è stata la messa a punto di un protocollo di amplificazione del DNA di Giardia da campioni ambientali, quali acque superficiali destinate alla potabilizzazione, acque di scarico, fanghi di supero destinati allo smaltimento agricolo e sedimenti lagunari del centro storico di Venezia. Il metodo usato può diventare di riferimento per la determinazione qualitativa e quantitativa del protozoo nella diverse matrici ambientali. Per ogni matrice sono stati ottimizzati specifici protocolli di estrazione ed amplificazione, raggiungendo in alcuni casi una sensibilità di0.07 pg di DNA